مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش Real-time PCRدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-6 دساتوراز در کشت سلولی رده PANC-1

نویسندگان

  • بیاگوی, شیما
  • دارابی, مسعود
  • سهمانی, مهدی
  • ناصرپورفریور, تقی
  • نجفی پور, رضا
چکیده مقاله:

  زمینه: استفاده از خاموش­کننده­های غیرفلورسنت در روش Real-time PCR برای بررسی بیان ژن مناسب است.   هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج Real-time PCR انجام شد.   مواد و روش­ها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلول­های سرطانی پانکراس انسان ( (PANC-1 در فلاسک­های 75 سانتی­متری کشت و تکثیر شدند. سپس 106×3 سلول در پلیت­های 6 خانه­ای تحت تأثیر داروهای مؤثر بر سیگنال­های خاص درون سلولی قرار گرفتند و میزان تغییر بیان ژن دلتا-6 دساتوراز در شرایط یکسان، یک بار با خاموش­کننده فلورسنت و بار دیگر با خاموش­کننده غیرفلورسنت با روش Real-time PCR بررسی شد. داده­ها با آزمون آماری تی و براساس روش ΔΔCT با فرض کارآیی 100 درصد تحلیل شدند.   یافته­ها: خاموش کننده­های فوق، با جذب متفاوت نشر گزارش­گر (Reporter) ، باعث تفاوت در نتایج حاصل از Real-time PCR شدند. پلات آمپلیفیکیشن هنگام استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت، دقیق­تر و میزان خط پایه ( Base line ) پایین­تر بود و به این ترتیب نسبت سیگنال به noise کاهش یافت. با استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت، به دلیل افزایش دمای ذوب (Tm) و کاهش اتصالات غیراختصاصی، میزان عددی دوره آستانه ( CT ) نیز کاهش یافت.   نتیجه­گیری: با توجه به یافته­ها، استفاده از خاموش­کننده غیرفلورسنت نسبت به فلورسنت مناسب­تر و جای­گزین بهتری برای خاموش کننده­های متداول، به خصوص در مطالعه­های تشخیصی آلل­ها و SNP (single nucleotide polymorphism) بود .    

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مقایسه خاموش کننده های فلورسنت و غیرفلورسنت روش real-time pcrدر پلات های آمپلیفیکیشن استاندارد ژن دلتا-۶ دساتوراز در کشت سلولی رده panc-۱

زمینه: استفاده از خاموش­کننده­های غیرفلورسنت در روش real-time pcr برای بررسی بیان ژن مناسب است.   هدف: مطالعه به منظور مقایسه توانایی دو نوع خاموش کننده فلورسنت و غیرفلورسنت با توجه به نتایج real-time pcr انجام شد.   مواد و روش­ها: این مطالعه تحلیلی در سال 1391 در آزمایشگاه رفرانس دانشگاه علوم پزشکی قزوین انجام شد. سلول­های سرطانی پانکراس انسان ( (panc-1 در فلاسک­های 75 سانتی­متری کشت و تکثیر ش...

متن کامل

بررسی اثرات عصاره هیدروالکلی جلبک Sargassum ciliforium بر رده سلولی سرطان کولون HT-29 و ارزیابی بیان ژن های P53 و APCبا روش Real time PCR

سرطان روده بزرگ سومین سرطان شایع در جهان است. با توجه به افزایش بروز سرطان استفاده از مولکول های جدید شیمی درمانی مورد نیاز می باشد. بسیاری از مطالعات و تحقیقات نشان داده است که سرطان روده می تواند از طریق محصولات دریایی طبیعی که دارای مقادیر بسیاری از مواد فعال بیولوژیکی با ساختارهای شیمیایی و فعالیت های دارویی جدید هستند درمان شود. هدف از این مطالعه بررسی اثرات عصاره هیدروالکلی جلبک Sargassum...

متن کامل

بررسی بیان ژن های CCDC26 و C-Kit در رده های سلولی لوسمی لنفوبلاستیک حاد

Background and Aim: Acute Lymphoblastic Leukemia is the most common cancer in children and is one of the main causes of their mortality. In this study, we examined the expression of long noncoding RNA CCDC26 gene and its downstream C-Kit gene in acute lymphocytic Leukemia cell line. Materials and Methods: This is an experimental study. In this study, the acute Lymphoblastic Leukemia cell lines...

متن کامل

بررسی سمیت سلولی نانوذره اکسید سریم (CeO2) روی رده سلولی سرطان کولون ( HT29 )و آنالیز بیان ژن های آپوپتوزی کاسپاز 3 و 9 با استفاده از روش Real Time PCR و فلوسیتومتری

هدف: هدف از مطالعه حاضر بررسی اثرات سمیت سلولی نانو ذره اکسید سریم روی رده سلولی سرطانی کلون HT29 و آنالیز بیان ژن‫های آپوپتوزیسی کاسپاز 3 و 9 می‫باشد. مواد و روش‫ها: در این مطالعه سلول‌های HT 29 در فواصل زمانی 24، 48 و 72 ساعت تحت تاثیر غلظت‌های  78/0، 56/1، 12/3، 25/6، 5/12، 25،50، 100 میلی‫گرم بر میلی‫لیتر از نانوذره اکسید سریم قرار گرفته و...

متن کامل

تعیین دامین های کارکردی و مدل توپولوژی ژن دلتا 6 دسچوراز غشائی قارچ Mortierella alpina

دسچورازها (EC: 1.14.19.3) کاتالیزگرهای واکنش دهیدروژناسیون بوده و باعث ایجاد پیوند دوگانه در زنجیره اسیدچرب می‌شوند. این آنزیم‌ها به دو گروه محلول و غشائی تقسیم گردیده، هر یک دارای موتیف‌های متفاوتی می‌باشند. با اینکه دلتا 6 دسچوراز آنزیم کلیدی در بیوسنتز اسیدهای‌چرب غیراشباع می‌باشد، ولی بخاطر غشایی بودن، ساختار کریستالی و سه‌بعدی آن تعیین نگردیده است. قارچ Mortierella alpina منبع غنی تولید اس...

متن کامل

تعیین دامین های کارکردی و مدل توپولوژی ژن دلتا 6 دسچوراز غشائی قارچ Mortierella alpina

دسچورازها (EC: 1.14.19.3) کاتالیزگرهای واکنش دهیدروژناسیون بوده و باعث ایجاد پیوند دوگانه در زنجیره اسیدچرب می‌شوند. این آنزیم‌ها به دو گروه محلول و غشائی تقسیم گردیده، هر یک دارای موتیف‌های متفاوتی می‌باشند. با اینکه دلتا 6 دسچوراز آنزیم کلیدی در بیوسنتز اسیدهای‌چرب غیراشباع می‌باشد، ولی بخاطر غشایی بودن، ساختار کریستالی و سه‌بعدی آن تعیین نگردیده است. قارچ Mortierella alpina منبع غنی تولید اس...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 17  شماره 5

صفحات  17- 24

تاریخ انتشار 2013-12

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023